Ismail Ben Ayed

Professeur

Department

Département de génie des systèmes

Degrees

B.Ing., M.Sc.A. (Sup'Com, Tunis), Ph.D. (INRS-EMT)

Office

A-3596

Ismail.BenAyed@etsmtl.ca

Research units

Research axe

Areas of expertise

Algorithmes de coupure de graphes
Algorithmes d'optimisation convexe
Analyse d’images médicales
Analyse d’images satellitaires
Vision par ordinateur
Traitement d’images
Apprentissage machine et reconnaissance de formes
Champs aléatoires de Markov (MRF)
Méthodes variationnelles basées sur les ensembles de niveaux
Segmentation d’images
Diagnostic assisté par ordinateur

Course

4 credits Automne 2023

4 credits Hiver 2024

Supervision

En codirection avec : Chakor, Hadi
Segmentation des vaisseaux sanguins de la rétine dans des images de fond, par Njeh Lajmi Cherif,Nihel
Automne 2020
En codirection avec : Bahig, Houda
Segmentation multi-modale du cancer de la sphère ORL à l’aide de CNNs en 3D, par Bechri,Adnane
Automne 2020

En codirection avec : Meyer, Patrick
« Natural Language Generation » et « Natural Language Understanding » pour les assistants conversationnels, par Kintzinger,Julien
Été 2020

En codirection avec : Piantanida, Pablo
Molecular Representation and Few Shot Adaptation for Drug Discovery, par Formont,Philippe
Été 2024
En codirection avec : Granger, Éric
Flexible and Scalable Models For Clustering and Few-Shot Learning, par Ziko,Imtiaz Masud
Été 2020
En codirection avec : Dolz, Jose
Test Time Adaptation and Train Time Generalization, par Murugesan,Balamurali
Été 2024
En codirection avec : Granger, Éric
Constrained Deep Networks for Medical Image Segmentation, par Kervadec,Hoel
Hiver 2021
En codirection avec : Desrosiers, Christian
Realistic Few-Shot Learning for Computer Vision, par Vargas Hakim,Gustavo Adolfo
Été 2024
En codirection avec : Desrosiers, Christian
6D Object Pose Estimation Based on Deep Learning, par Bahri,Ali
Été 2024
En codirection avec : Desrosiers, Christian
Domain Generalization on Image Classification, par Cheraghalikhani,Milad
Été 2024
En codirection avec : Desrosiers, Christian
Zero-Shot 6DOF Pose Estimation using deep learning, par Yazdanpanah,Moslem
Été 2024
En codirection avec : Lombaert, Hervé
Domain Adaptation with Missing Data for Medical Image Segmentation, par Bateson,Mathilde
Été 2023
En codirection avec : Pedersoli, Marco
Learning Visual Recognition Models with Limited Data, par Mounsaveng,Saypraseuth
Automne 2023
En codirection avec : Granger, Éric
Optimization Problems for Deep Neural Networks, par Rony,Jérôme
Été 2023
En codirection avec : Piantanida, Pablo
Transductive Few-shot Learning, par Boudiaf,Malik
Été 2023
En codirection avec :
Learning Generalizable Representations for Medical Imaging Tasks, par Shakeri,Fereshteh
Été 2024
En codirection avec : Desrosiers, Christian
Computer Vision Methods Adapting to New Domains with few Samples, par Osowiechi,David
Été 2024
En codirection avec : Desrosiers, Christian
Vision-Based Unseen Domain Generalization using Deep Learning, par Noori,Mehrdad
Été 2024
En codirection avec : Dolz, Jose
Generalized Few-Shot Learning, par Hajimiri,Seyed Mohammadsina
Été 2024

En codirection avec : Bahig, Houda
La vraie utilité de l’adaptation des paramètres des couches de normalisation d’un CNN en Fully Test Time Adaptation, par Baklouti,Ghassen
Été 2023
En codirection avec :
Segmentation automatique de la colonne vertébrale lombaire à partir d'images à résonance magnétique par combinaison de réseau de neurones convolutifs et coupe de graphe, par Ben Dhaou,Firas
Été 2019
En codirection avec : Granger, Éric
Feed-Forward Weakly Supervised Deep Learning Models for Breast Cancer Diagnosis from Histological Images, par Rony,Jérôme
Été 2019
En codirection avec :
Évaluation réaliste de l’apprentissage Few-Shot transductif, par Veilleux,Olivier
Hiver 2022
En codirection avec : Dolz, Jose
Étude sur les modèles multi-modaux entrainés à large échelle dans le contexte médical, par Djomby,Damien
Hiver 2024
En codirection avec : Dolz, Jose
Segmentation d’images médicales semi-supervisée par curriculum via l’inférence des boîtes englobantes, par Cyusa Mukama,Bruce
Automne 2021

Publications

Mariam Afshin, Ismail Ben Ayed, Kumaradevan Punithakumar, Max Law, Ali Islam, Aashish Goela, Terry Peters, Shuo Li. 2017-08-29 « Automating Cardiac Disease Detection ». Substance ÉTS
Mariam Afshin, Ismail Ben Ayed, Kumaradevan Punithakumar, Max Law, Ali Islam, Aashish Goela, Terry Peters, Shuo Li. 2017-08-29 « Automatiser le dépistage des maladies cardiaques ». Substance ÉTS

Shengziang Deng, Ismail Ben Ayed, Hongpeng Sun. 2024 « A preconditioned alternating minimization framework for nonconvex and half quadratic regularization ». Inverse Problems and Imaging
Bingyuan Liu, Jose Dolz, Adrian Galdran, Riadh Kobbi, Ismail Ben Ayed. 2024 « Do we really need dice? The hidden region-size biases of segmentation losses ». Medical Image Analysis vol. 91
Mehrdad Noori, Milad Cheraghalikhani, Ali Bahri, Gustavo A. Vargas Hakim, David Osowiechi, Ismail Ben Ayed, Christian Desrosiers. 2024 « TFS-ViT: Token-level feature stylization for domain generalization ». Pattern Recognition vol. 149
Bingyuan Liu, Christian Desrosiers, Ismail Ben Ayed, Jose Dolz. 2023 « Segmentation with mixed supervision: Confidence maximization helps knowledge distillation ». Medical Image Analysis vol. 83
Balamurali Murugesan, Bingyuan Liu, Adrian Galdran, Ismail Ben Ayed, Jose Dolz. 2023 « Calibrating segmentation networks with margin-based label smoothing ». Medical Image Analysis vol. 87
Marine Picot, Francisco Messina, Malik Boudiaf, Fabrice Labeau, Ismail Ben Ayed, Pablo Piantanida. 2023 « Adversarial robustness via Fisher-Rao Regularization ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 45 , nº 3. p. 2698-2710
Mathilde Bateson, Hoel Kervadec, Jose Dolz, Hervé Lombaert, Ismail Ben Ayed. 2022 « Source-free domain adaptation for image segmentation ». Medical Image Analysis vol. 82
Soufiane Belharbi, Jérôme Rony, Jose Dolz, Ismail Ben Ayed, Luke McCaffrey, Eric Granger. 2022 « Deep interpretable classification and weakly-supervised segmentation of histology images via max-min uncertainty ». IEEE Transactions on Medical Imaging vol. 41 , nº 3. p. 702-714
A. Galdran, H. Chakor, W. Kabir, R. Kobbi, B. Liu, J. Dolz, I. Ben Ayed. 2022 « An automatic deep learning-based system for screening and management of DME ». Diabetes Research and Clinical Practice vol. 186 , nº Suppl. 1. p. 4-5
Adrian Galdran, André Anjos, José Dolz, Hadi Chakor, Hervé Lombaert, Ismail Ben Ayed. 2022 « State-of-the-art retinal vessel segmentation with minimalistic models ». Scientific Reports vol. 12 , nº 1
M. Bateson, J. Dolz, H. Kervadec, H. Lombaert, I. Ben Ayed. 2021 « Constrained domain adaptation for image segmentation ». IEEE Transactions on Medical Imaging vol. 40 , nº 7. p. 1875-1887
Mohammed Jabi, Marco Pedersoli, Amar Mitiche, Ismail Ben Ayed. 2021 « Deep clustering: On the link between discriminative models and K-means ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 43 , nº 6. p. 1887-1896
Hoel Kervadec, Jihene Bouchtiba, Christian Desrosiers, Eric Granger, José Dolz, Ismail Ben Ayed. 2021 « Boundary loss for highly unbalanced segmentation ». Medical Image Analysis vol. 67
Madhu Kiran, Amran Bhuiyan, Le Thanh Nguyen-Meidine, Louis-Antoine Blais-Morin, Ismail Ben Ayed, Eric Granger. 2021 « Flow guided mutual attention for person re-identification ». Image and Vision Computing vol. 113
Hugo Masson, Amran Bhuiyan, Le Thanh Nguyen-Meidine, Mehrsan Javan, Parthipan Siva, Ismail Ben Ayed, Eric Granger. 2021 « Exploiting prunability for person re-identification ». Eurasip Journal on Image and Video Processing vol. 2021 , nº 1
Shanshan Wang, Cheng Li, Rongpin Wang, Zaiyi Liu, Meiyun Wang, Hongna Tan, Yaping Wu, Xinfeng Liu, Hui Sun, Rui Yang, Xin Liu, Jie Chen, Huihui Zhou, Ismail Ben Ayed, Hairong Zheng. 2021 « Annotation-efficient deep learning for automatic medical image segmentation ». Nature Communications vol. 12 , nº 1
Jose Dolz, Christian Desrosiers, Li Wang, Jing Yuan, Dinggang Shen, Ismail Ben Ayed. 2020 « Deep CNN ensembles and suggestive annotations for infant brain MRI segmentation ». Computerized Medical Imaging and Graphics vol. 79
Adrian Galdran, Jihed Chelbi, Riadh Kobi, José Dolz, Hervé Lombaert, Ismail Ben Ayed, Hadi Chakor. 2020 « Non-uniform label smoothing for diabetic retinopathy grading from retinal fundus images with deep neural networks ». Translational Vision Science and Technology vol. 9 , nº 2
Jizong Peng, Hoel Kervadec, Jose Dolz, Ismail Ben Ayed, Marco Pedersoli, Christian Desrosiers. 2020 « Discretely-constrained deep network for weakly supervised segmentation ». Neural Networks vol. 130. p. 297-308
Kumaradevan Punithakumar, Ismail Ben Ayed, Abraam S. Soliman, Aashish Goela, Ali Islam, Shuo Li, Michelle Noga. 2020 « 3D motion estimation of left ventricular dynamics using MRI and track-to-track fusion ». IEEE Journal of Translational Engineering in Health and Medicine vol. 8
Ruobing Shen, Bo Tang, Andrea Lodi, Andrea Tramontani, Ismail Ben Ayed. 2020 « An ILP model for multi-label MRFs with connectivity constraints ». IEEE Transactions on Image Processing vol. 29. p. 6909-6917
Jose Dolz, Karthik Gopinath, Jing Yuan, Herve Lombaert, Christian Desrosiers, Ismail Ben Ayed. 2019 « HyperDense-Net: A hyper-densely connected CNN for multi-modal image segmentation ». IEEE Transactions on Medical Imaging vol. 38 , nº 5. p. 1116-1126
Adrian Galdran, Hadi Chakor, Abdulaziz Abdulaziz, Ryad Kobbi, Argyrios Christodoulidis, Jihed Chelbi, Marc-André Racine, Ismail Ben Ayed. 2019 « Automatic classification and triage of diabetic retinopathy from retinal images based on a convolutional neural networks (CNN) method ». Acta Ophthalmologica vol. 97. p. 2
Hoel Kervadec, Jose Dolz, Meng Tang, Éric Granger, Yuri Boykov, Ismail Ben Ayed. 2019 « Constrained-CNN losses for weakly supervised segmentation ». Medical Image Analysis vol. 54. p. 88-99
Dmitrii Marin, Meng Tang, Ismail Ben Ayed, Yuri Y. Boykov. 2019 « Kernel clustering: density biases and solutions ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 41 , nº 1. p. 136-147
Meng Tang, Dmitrii Marin, Ismail Ben Ayed, Yuri Boykov. 2019 « Kernel cuts: Kernel and spectral clustering meet regularization ». International Journal of Computer Vision vol. 127 , nº 5. p. 477-511
Li Wang, Dong Nie, Li Guannan, Élodie Puybareau, Jose Dolz, Qian Zhang, Fan Wang, Jing Xia, Zhengwang Wu, Jia-Wei Chen, Kim-Han Thung, Toan Duc Bui, Jitae Shin, Guodong Zeng, Guoyan Zheng, Vladimir S. Fonov, Andrew Doyle, Yongchao Xu, Pim Moeskops, Josien P. W. Pluim, Christian Desrosiers, Ismail Ben Ayed, Gerard Sanroma, Oualid M. Benkarim, Adrià Casamitjana, Verónica Vilaplana, Weili Lin, Gang Li, Dinggang Shen. 2019 « Benchmark on automatic six-month-old infant brain segmentation algorithms: the iSeg-2017 challenge ». IEEE Transactions on Medical Imaging vol. 38 , nº 9. p. 2219-2230
Xiaopan Xu, Xi Zhang, Qian Tian, Huanjun Wang, Long-Biao Cui, Shurong Li, Xing Tang, Baojun Li, Jose Dolz, Ismail Ben Ayed, Zhengrong Liang, Jing Yuan, Peng Du, Hongbing Lu, Yang Liu. 2019 « Quantitative identification of nonmuscle-invasive and muscle-invasive bladder carcinomas: a multiparametric MRI radiomics analysis ». Journal of Magnetic Resonance Imaging vol. 49 , nº 5. p. 1489-1498
Aaron Carass, Jennifer L. Cuzzocreo, Shuo Han, Carlos R. Hernandez-Castillo, Paul E. Rasser, Melanie Ganz, Vincent Beliveau, Jose Dolz, Ismail Ben Ayed, Christian Desrosiers, Benjamin Thyreau, José E. Romero, Pierrick Coupé, José V. Manjón, Vladimir S. Fonov, D. Louis Collins, Sarah H. Ying, Chiadi U. Onyike, Deana Crocetti, Bennett A. Landman, Stewart H. Mostofsky, Paul M. Thompson, Jerry L. Prince. 2018 « Comparing fully automated state-of-the-art cerebellum parcellation from magnetic resonance images ». NeuroImage vol. 183. p. 150-172
Jose Dolz, Christian Desrosiers, Ismail Ben Ayed. 2018 « 3D fully convolutional networks for subcortical segmentation in MRI: A large-scale study ». NeuroImage vol. 170. p. 456-470
Jose Dolz, Xiaopan Xu, Jérôme Rony, Jing Yuan, Yang Liu, Éric Granger, Christian Desrosiers, Xi Zhang, Ismail Ben Ayed, Hongbing Lu. 2018 « Multiregion segmentation of bladder cancer structures in MRI with progressive dilated convolutional networks ». Medical Physics vol. 45 , nº 12. p. 5482-5493
Tobias Fechter, Sonja Adebahr, Dimos Baltas, Ismail Ben Ayed, Christian Desrosiers, Jose Dolz. 2017 « Esophagus segmentation in CT via 3D fully convolutional neural network and random walk ». Medical Physics vol. 44 , nº 12. p. 6341-6352
Lena Gorelick, Yuri Boykov, Olga Veksler, Ismail Ben Ayed, Andrew Delong. 2017 « Local submodularization for binary pairwise energies ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 39 , nº 10. p. 1985-1999
Seyed-Parsa Hojjat, Ismail Ayed, Gregory J. Garvin, Kumaradevan Punithakumar. 2017 « Spine labeling in MRI via regularized distribution matching ». International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery vol. 12 , nº 11. p. 1911-1922
Byong jun Hwang, Jinchang Ren, Samuel McCormack, Craig Berry, Ismail Ben Ayed, Hans C. Graber, Erchan Aptoula. 2017 « A practical algorithm for the retrieval of floe size distribution of Arctic sea ice from high-resolution satellite Synthetic Aperture Radar imagery ». Elementa : Science of Anthropocene vol. 38 , nº 5
Yosra Mathlouthi, Amar Mitiche, Ismail Ben Ayed. 2017 « Regularised differentiation for image derivatives ». IET Image Processing vol. 11 , nº 5. p. 310-316
Yosra Mathlouthi, Amar Mitiche, Ismail Ben Ayed. 2016 « Monocular, boundary-preserving joint recovery of scene flow and depth ». Frontiers in ICT vol. 3 , nº 21
Brandon Miles, Ismail Ben Ayed, Seyed-Parsa Hojjat, Michael H. Wang, Shuo Li, Aaron Fenster, Gregory J. Garvin. 2016 « Spine labeling in axial magnetic resonance imaging via integral kernels ». Computerized Medical Imaging and Graphics vol. 54. p. 27-34
Kumaradevan Punithakumar, Ismail Ben Ayed, Mariam Afshin, Aashish Goela, Ali Islam, Shuo Li, Pierre Boulanger, Harald Becher, Michelle Noga. 2016 « Detecting left ventricular impaired relaxation in cardiac MRI using moving mesh correspondences ». Computer Methods and Programs in Biomedicine vol. 124. p. 58-66
Ismail Ben Ayed, Kumaradevan Punithakumar, Shuo Li. 2015 « Distribution matching with the Bhattacharyya similarity: a bound optimization framework ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 37 , nº 9. p. 1777-1791
Amar Mitiche, Yosra Mathlouthi, Ismail Ben Ayed. 2015 « Monocular concurrent recovery of structure and motion scene flow ». Frontiers in ICT vol. 2
Ines Njeh, Lamia Sallemi, Ismail Ben Ayed, Khalil Chtourou, Stephane Lehericy, Damien Galanaud, Ahmed Ben Hamida. 2015 « 3D multimodal MRI brain glioma tumor and edema segmentation: a graph cut distribution matching approach ». Computerized Medical Imaging and Graphics vol. 40. p. 108-119
Caroline Petitjean, Maria A. Zuluaga, Wenjia Bai, Jean-Nicolas Dacher, Damien Grosgeorge, Jérôme Caudron, Su Ruan, Ismail Ben Ayed, M. Jorge Cardoso, Hsiang-Chou Chen, Daniel Jimenez-Carretero, Maria J. Ledesma-Carbayo, Christos Davatzikos, Jimit Doshi, Guray Erus, Oskar M. O. Maier, Cyrus M. S. Nambakhsh, Yangming Ou, Sébastien Ourselin, Chun-Wei Peng, Nicholas S. Peters, Terry M. Peters, Martin Rajchl, Daniel Rueckert, Andres Santos, Wenzhe Shi, Ching-Wei Wang, Haiyan Wang, Jing Yuan. 2015 « Right ventricle segmentation from cardiac MRI: a collation study ». Medical Image Analysis vol. 19 , nº 1. p. 187-202
Kumaradevan Punithakumar, Michelle Noga, Ismail Ben Ayed, Pierre Boulanger. 2015 « Right ventricular segmentation in cardiac MRI with moving mesh correspondences ». Computerized Medical Imaging and Graphics vol. 43. p. 15-25
Mariam Afshin, Ismail Ben Ayed, Kumaradevan Punithakumar, Max Law, Ali Islam, Aashish Goela, Terry Peters, Shuo Li. 2014 « Regional assessment of cardiac left ventricular myocardial function via MRI statistical features ». IEEE Transactions on Medical Imaging vol. 33 , nº 2. p. 481-494
Mohamed Ben Salah, Ismail Ben Ayed, Yuan Jing, Zhang Hong. 2014 « Convex-relaxed kernel mapping for image segmentation ». IEEE Transactions on Image Processing vol. 23 , nº 3. p. 1143-1153
Brandon Miles, Ismail Ben Ayed, Max W. K. Law, Greg Garvin, Aaron Fenster, Shuo Li. 2013 « Spine image fusion via graph cuts ». IEEE Transactions on Biomedical Engineering vol. 60 , nº 7. p. 1841-1850
Cyrus M. S. Nambakhsh, Yuan Jing, Kumaradevan Punithakumar, Aashish Goela, Martin Rajchl, Terry M. Peters, Ismail Ben Ayed. 2013 « Left ventricle segmentation in MRI via convex relaxed distribution matching ». Medical Image Analysis vol. 17 , nº 8. p. 1010-1024
Kumaradevan Punithakumar, Ismail Ben Ayed, Ali Islam, Aashish Goela, Ian G. Ross, Jaron Chong, Shuo Li. 2013 « Regional heart motion abnormality detection: An information theoretic approach ». Medical Image Analysis vol. 17 , nº 3. p. 311-324
Ismail Ben Ayed, Hua-mei Chen, Kumaradevan Punithakumar, Ian Ross, Shuo Li. 2012 « Max-flow segmentation of the left ventricle by recovering subject-specific distributions via a bound of the Bhattacharyya measure ». Medical Image Analysis vol. 16 , nº 1. p. 87-100
Mohamed Ben Salah, Ismail Ben Ayed, Amar Mitiche. 2012 « Active curve recovery of region boundary patterns ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 34 , nº 5. p. 834-849
Kumaradevan Punithakumar, Jing Yuan, Ismail Ben Ayed, Shuo Li, Yuri Boykov. 2012 « A convex max-flow approach to distribution-based figure-ground separation ». SIAM Journal on Imaging Sciences vol. 5 , nº 4. p. 1333-1354
Mohamed Ben Salah, Amar Mitiche, Ismail Ben Ayed. 2011 « Multiregion image segmentation by parametric kernel graph cuts ». IEEE Transactions on Image Processing vol. 20 , nº 2. p. 545-557
Mohamed Ben Salah, Amar Mitiche, Ismail Ben Ayed. 2010 « Effective level set image segmentation with a kernel induced data term ». IEEE Transactions on Image Processing vol. 19 , nº 1. p. 220-232
Kumaradevan Punithakumar, Ismail Ben Ayed, Ali Islam, Ian G. Ross, Shuo Li. 2010 « Tracking endocardial motion via multiple model filtering ». IEEE Transactions on Biomedical Engineering vol. 57 , nº 8. p. 2001-2010
Kumaradevan Punithakumar, Ismail Ben Ayed, Ian G. Ross, Ali Islam, Jaron Chong, Shuo Li. 2010 « Detection of left ventricular motion abnormality via information measures and Bayesian filtering ». IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine vol. 14 , nº 4. p. 1106-1113
Ismail Ben Ayed, Shuo Li, Ian Ross. 2009 « A statistical overlap prior for variational image segmentation ». International Journal of Computer Vision vol. 85 , nº 1. p. 115-132
Ismail Ben Ayed, Shuo Li, Ian Ross. 2009 « Embedding overlap priors in variational left ventricle tracking ». IEEE Transactions on Medical Imaging vol. 28 , nº 12. p. 1902-1913
Ismail Ben Ayed, Shuo Li, Ian Ross, Ali Islam. 2009 « Myocardium tracking via matching distributions ». International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery vol. 4 , nº 1. p. 37-44
Ismail Ben Ayed, Amar Mitiche. 2008 « A region merging prior for variational level set image segmentation ». IEEE Transactions on Image Processing vol. 17 , nº 12. p. 2301-2311
Ismail Ben Ayed, Nacera Hennane, Amar Mitiche. 2006 « Unsupervised variational image segmentation/classification using a weibull observation model ». IEEE Transactions on Image Processing vol. 15 , nº 11. p. 3431-3439
Ismail Ben Ayed, Amar Mitiche, Ziad Belhadj. 2006 « Polarimetric image segmentation via maximum-likelihood approximation and efficient multiphase level-sets ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 28 , nº 9. p. 1493-1500
Ismail Ben Ayed, Amar Mitiche, Ziad Belhadj. 2005 « Multiregion level-set partitioning of synthetic aperture radar images ». IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence vol. 27 , nº 5. p. 793-800

Ismail Ben Ayed, Dmitry Pavlov, Kumaradevan Punithakumar, Seyed-Parsa Hojjat, Gregory Garvin. 2018-02-06 « Methods and apparatus to label radiology images ».
Ismail Ben Ayed, Kumaradevan Punithakumar, Seyed-parsa Hojjat, Gregory Garvin. 2015-06-23 « Methods and apparatus to generate three-dimensional spinal renderings ».
Ismail Ben Ayed, Kumaradevan Punithakumar, Sukhdeep Gill, Gregory John Garvin. 2015-02-24 « Automatic detection of vertebrae boundaries in spine images ».
Kumaradevan Punithakumar, Shuo Li, Ismail Ben Ayed, Ian Ross, Ali Islam, Richard Rankin. 2014-08-19 « Methods, apparatus and articles of manufacture to track endocardial motion ».
Kumaradevan Punithakumar, Shuo Li, Ismail Ben Ayed, Ian Ross, Ali Islam, Richard Rankin. 2013-07-02 « Methods, apparatus and articles of manufacture to process cardiac images to detect heart motion abnormalities ».
Shuo Li, Ismail Ben Ayed, Ian Ross, Richard Rankin. 2012-03-27 « Systems and methods for tracking images ».

Frank R. Schmidt, Lena Gorelick, Ismail Ben Ayed, Yuri Boykov, Thomas Brox. 2016 « Shape distances for binary image segmentation ».
Ismail Ben Ayed. 2014 « Distribution matching approaches to medical image segmentation ».

Ismail Ben Ayed, Christian Desrosiers, Jose Dolz. 2019 « Tutorial : Weakly supervised CNN segmentation: Models and optimization ». Communication lors de la conférence : Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI) (Shenzen, China, Oct. 13-17, 2019)
Ismail Ben Ayed. 2015 « Optimisation et apprentissage pour l'analyse d'images médicales ». Communication lors de la conférence : Centre de recherche du Centre hospitalier de l’Université de Montréal (CRCHUM) (Montréal, QC, Canada, Nov. 2015)
Yuri Boykov, Hossam Isack, Carl Olsson, Ismail Ben Ayed. 2015 « Volumetric bias in segmentation and reconstruction: Secrets and solutions ». Communication lors de la conférence : IEEE International Conference on computer vision (Santiago, Chile, Dec. 11-18, 2015)
Meng Tang, Ismail Ben Ayed, Dmitrii Marin, Yuri Boykov. 2015 « Secrets of GrabCut and Kernel K-Means ». Communication lors de la conférence : IEEE International Conference on computer vision (Santiago, Chile, Dec. 11-18, 2015)
Yuri Boykov, Ismail Ben Ayed, Daniel Cremers, Milan Sonka. 2014 « Medical image segmentation: beyond level-sets (MICCAI 2014 Tutorial) ». Communication lors de la conférence : Medical Image Computing and Computer Assited Intervention Conference (MICCAI 2014) (Cambridge, MA, USA, Sept. 14-18, 2014)